Lo que puedes hacer es que una vez que escriba una fila en un word, al final de la fila colocar un dato auxiliar (Ejemplo: “Escrita”) y en el FOR que usas para recorrer los datos leidos del Excel, decides si escribirla o no en función de ese dato auxiliar.

Otra opción es colocar como dato auxiliar un numero en una celda que represente la fila de la ultima celda escrita entonces lees esa celda y utilizas el dato como restricción del rango de lectura, asi la lectura del Excel siempre arrancara desde esa fila, para evitar iterar sobre demasiados datos.